El MAF nace a finales del siglo XIX para acoger la herencia de las colecciones arqueológicas florentinas, creadas con el pasar de los siglos por los Médicis y por los Lorena. Hoy la exposición está estructurada en tres grandes secciones – la Sección Etrusca, la Sección de las Antiguas Colecciones y la Sección del “Museo Egipcio” -, más un gran jardín monumental con la reconstrucción de tumbas etruscas. La colección egipcia, una de las más grandes en Italia, comprende un carro de caza de madera de Tebas, el célebre relieve de la diosa Maat, numerosas momias y uno de los retratos de Fayum, además de una considerable colección de prendas y tejidos de época copta. En la sección de las Antiguas Colecciones se encuentran los grandes bronces de la Quimera, del Arringatore (Orador), de la Minerva de Arezzo y de la cabeza de caballo. La Quimera, símbolo del Museo, representa el monstruo de tres cabezas (de león, cabra y serpiente) derrotado por el héroe Belerofonte. Entre las otras obras maestras expuestas destaca el Vaso François, una crátera ática de figuras negras del siglo VI A.C., decorado con escenas de mitos griegos.